Η αποστολή της ΣΕΚ εστιάζεται στην προστασία των εργαζομένων και της προώθησης κοινωνικοοικονομικών πολιτικών που βελτιώνουν τη θέση των εργαζομένων αλλά και της κοινωνίας γενικότερα.

Μέσα σε αυτό το πλαίσιο, η αποστολή της ΣΕΚ διαμορφώνεται στους πιο κάτω άξονες:

• Οργάνωση μελών ως μέλη της ΣΕΚ (συνταγματικό και νομοθετικό δικαίωμα),
• Συνομολόγηση Συλλογικών Συμβάσεων που διέπουν του όρους απασχόλησης των εργαζομένων σε κάθε επιχείρηση/οργανισμό,
• Βελτίωση μισθών και άλλων ωφελημάτων,
• Προώθηση κοινωνικής πολιτικής,
• Προώθηση της ισότητας στην απασχόληση και στην κοινωνία, όπως επίσης και καταπολέμηση κάθε μορφής διάκρισης,
• Επίλυση εργατικών προβλημάτων,
• Προώθηση όλων των θεμάτων που άπτονται της ασφάλειας και υγείας των εργαζομένων,
• Αντιμετώπιση κάθε μορφής παρενόχλησης στους χώρους εργασίας,
• Προώθηση και αναβάθμιση του κοινωνικού διαλόγου,
• Βελτίωση του βιοτικού επιπέδου των εργαζομένων και της κοινωνίας ευρύτερα.